Era il 2001. Dopo quasi quattro decenni di avventure gli X-Men mutarono in qualcosa di completamente diverso. Il visionario scrittore Grant Morrison e i suoi collaboratori artistici reimmaginarono gli eroi mutanti, dando loro un nuovo look e una nuova missione, quella di fronteggiare un mondo di originali minacce: malefiche gemelle amanti del genocidio, macabri ibridi per la crescita di organi, batteri senzienti, giovani ribelli mutanti, droghe che aumentano i poteri, invasioni aliene, armi viventi e altro ancora! Al fondatore degli X-Men Charles Xavier, al coscienzioso vice leader Ciclope e alla sua combattiva moglie Jean Grey, all'animalesco e intellettuale Bestia e al selvaggio guerriero Wolverine, si aggiungono due improbabili nuove reclute: la maliziosa telepate Emma Frost e la misteriosa potenza nota come Xorn. Insieme, rendono pubblici gli X-Men esponendo i loro segreti al mondo, dando alla squadra una presenza globale attraverso la corporazione internazionale X-Corporation ed espandendo la scuola di Xavier per formare una nuova generazione di mutanti, che comprende l'insettiforme Angel, il ragazzo-uccello Becco, la tempesta di sabbia vivente Dust e le cinque inquietanti gemelle telepati note come le Naiadi di Stepford. Altri cambiamenti nella vita dei protagonisti entrano in gioco quando l'aumento di "mutazioni secondarie" vede familiari mutanti evolvere verso nuove forme e nuovi poteri...)